L'aéroport international de Chisinau, code RMO, est la seule porte d'entrée aérienne du pays. Une vingtaine de compagnies y opèrent et desservent environ 75 destinations réparties dans une trentaine de pays.
Depuis Paris, Bruxelles ou Genève, le vol dure un peu plus de 3 heures. Les autres solutions demandent beaucoup plus de temps, avec plus de 40 heures d'autocar, environ 26 heures de conduite ou 2 jours de train avec une nuit en couchette au départ de Bucarest. L'avion est le seul mode qui permet d'arriver le jour même du départ, et la concurrence entre compagnies à bas coût a tiré les prix vers le bas.
Wizz Air Malta est de loin le premier opérateur, avec environ 35 destinations. Viennent ensuite la compagnie moldave FlyOne, puis SkyUp et HiSky. Les compagnies classiques desservent surtout leurs plateformes de correspondance, Turkish Airlines vers Istanbul, Austrian vers Vienne, Lufthansa vers Francfort et Munich, LOT vers Varsovie, airBaltic vers Riga et Pegasus vers Sabiha Gökçen. Passer par l'un de ces hubs reste la solution la plus souple quand les vols directs ne collent pas aux dates.
Paris dispose de deux liaisons directes. Beauvais est la mieux desservie, avec Wizz Air, SkyUp et HiSky. Roissy-Charles-de-Gaulle est également relié, pour un temps de vol d'environ 3 h 15. Nice complète l'offre française. Côté belge, Bruxelles-Zaventem et Bruxelles-Charleroi sont tous deux desservis. FlyOne relie Genève à Chisinau 2 fois par semaine et Bâle-Mulhouse figure aussi au réseau. Ces fréquences varient d'une saison à l'autre et méritent d'être vérifiées avant toute réservation.
L'aéroport se trouve à 13 kilomètres au sud-est du centre, soit 20 à 40 minutes selon la circulation. Le trolleybus 30 rejoint la rue 31 August 1989 en 35 minutes environ et le minibus 165 dessert la rue Ismail. Le billet coûte 6 à 7 lei, moins de 50 centimes d'euro, mais ces véhicules conviennent mal aux gros bagages.
Les taxis attendent devant les arrivées et la course vers le centre revient à 115 à 150 lei, le plus souvent en espèces et sans tarif affiché, si bien qu'un accord sur le prix avant de monter reste préférable. L'application Yandex Go donne un prix fixe à l'avance, mais les voitures se raréfient après 23 heures. Aucune desserte ferroviaire ne relie l'aéroport à la ville et Chisinau n'a pas de métro.