La Moldavie est un pays de collines et de vallées, sans littoral ni montagne. Le relief le plus marqué se trouve au centre, dans les Codri, où se concentrent les plus grandes surfaces boisées. La forêt couvre un peu moins de 13 % du territoire.
Les autorités reconnaissent plusieurs faiblesses, notamment les dépôts de déchets sauvages, les coupes illégales et des réseaux d'assainissement insuffisants. Un programme national de reboisement court sur la décennie 2023-2032, avec le soutien financier de l'Agence française de développement.
Chisinau est une capitale verte, ce qui surprend souvent les visiteurs. Le jardin public Ștefan cel Mare, créé en 1818, est le plus ancien parc du pays. Le parc Valea Morilor descend en pente douce vers un lac et reste le lieu de promenade favori des habitants. Le Dendrariu et le Jardin botanique, qui est aussi un institut de recherche, complètent l'offre du centre. La Vallée des Roses et le parc La Izvor offrent les plus grandes surfaces.
Le pays compte plus de 300 aires protégées, soit environ 5 % du territoire. Cinq réserves scientifiques en forment le cœur, Codrii, Plaiul Fagului, Pădurea Domnească, Prutul de Jos et Iagorlîc, avec le parc national d'Orhei et la réserve de biosphère du Bas-Prut.
La réserve de Codrii, la plus proche de la capitale, associe un noyau strictement protégé, une zone tampon de forêts en cours de restauration et une zone de transition où l'agriculture reste encadrée.
Codrii abrite environ la moitié des espèces végétales du pays. Le chêne et le hêtre dominent, avec des sujets de plus de 150 ans, et la faune mêle des espèces d'Europe centrale à des populations venues des Balkans, des Carpates et d'Asie. Les zones humides du Prut, au sud, forment le second grand réservoir de biodiversité, en particulier pour les oiseaux d'eau.
Il n'existe pas de réseau de sentiers balisés comparable à celui des massifs alpins. On marche surtout dans les réserves et le long des rivières, dans la vallée du Răut autour d'Orheiul Vechi ou dans les forêts de Codrii. Les dénivelés sont faibles et les principaux sites se visitent à la journée depuis Chisinau. Le printemps et le début de l'automne restent les meilleures périodes.
La chasse est encadrée par un règlement de 2021 et organisée pour l'essentiel par la société des chasseurs et pêcheurs. Il faut réunir un carnet de chasseur, une autorisation de chasse et un permis de port d'arme. Pour un étranger, passer par un organisateur local reste la seule voie praticable.