Chisinau occupe le centre de la Moldavie, sur les collines qui bordent le Bâc. Le centre historique se tient sur la rive droite, tandis que les quartiers industriels se sont installés plus bas, le long de la vallée et de la voie ferrée.
Le relief explique l'organisation urbaine. Les pentes de la rive droite portent le damier du XIXe siècle, facile à parcourir à pied. Le boulevard Stefan cel Mare si Sfant en est l'épine dorsale et sert de repère à presque toutes les adresses. Les grands ensembles de logements se déploient au-delà, sur les plateaux, et sont desservis par trolleybus et minibus.
Deux autres axes complètent la lecture de la ville, le boulevard Dacia vers le sud et l'aéroport, le boulevard Moscova vers le nord-est. La gare ferroviaire et les deux gares routières se trouvent dans le secteur Centru. L'aéroport international Eugen Doga est à 13 km au sud-est.
La municipalité est divisée en cinq secteurs, Centru, Buiucani, Riscani, Botanica et Ciocana. Chacun est administré par une prétoriale dont le responsable est nommé par la mairie générale. Au-delà de la ville, la municipalité rassemble une trentaine de localités et comptait 720 128 habitants au dernier recensement.
Centru concentre les institutions, les ambassades, les musées nationaux, la gare et les marchés. C'est le secteur où logent la plupart des visiteurs.
Buiucani s'étend au nord-ouest. Il abrite le parc Dendrariu, le parc Valea Morilor et le plus grand cimetière juif de Moldavie.
Botanica, au sud, est le secteur le plus peuplé. On y trouve le jardin zoologique, le Jardin botanique national, le stade Zimbru, l'aéroport et les grands centres commerciaux.
Riscani occupe le nord-est, en partie séparé du reste de la ville par un pont. Son artère principale est le boulevard Moscova.
Ciocana ferme la ville à l'est et reste l'un des secteurs les plus industriels. La station balnéaire de Vadul lui Voda, au bord du Dniestr, lui est rattachée.
Les adresses moldaves s'écrivent avec le type de voie devant le nom, strada pour une rue, bulevardul pour un boulevard, soseaua pour une route. Le numéro suit. Beaucoup de rues ont changé de nom après 1991 et les anciennes appellations circulent encore dans les conversations et sur d'anciens plans.
Pour les transports urbains, les applications EasyWay et Moovit couvrent les lignes de trolleybus et de minibus, tandis que iTaxi et YandexGo servent à appeler un taxi. Les cartes bancaires passent dans la plupart des commerces, mais les espèces restent utiles pour les petits achats et les transports en commun.